牧養與諮商
- 能在教會從事牧養關懷事工時，結合牧養與諮商，踩對角色與位置，妥善並適時地運用諮商技巧與原則，幫助所關懷的羊群得到身心靈健全的發展。
修課條件：必須修過【諮商理論與牧靈】、【牧靈諮商技巧（上）】。
臨終關懷
《寒假課程》- 認識台灣常見各種宗教對死亡的看法，特別是基督信仰為主。認識臨終病人生理、 心理、靈性的照顧。了解家屬需求、關懷原則與方法，並協助家屬克服死亡哀傷。
悲傷輔導與牧靈
- 能理解諮商理論於悲傷歷程中的概念，體驗並學習如何運用屬靈操練及內在醫治於悲傷輔導中，以增加其整合運用能力。具備悲傷諮商技術實作能力並且能應用悲傷的諮商理論與技術於教牧悲傷輔導。
修課條件：必須修過【屬靈操練(一)】
參訪與見習督導
《暑假課程》- 實地實習中初步了解各助人機構、特殊族群與特殊事工之風貌和實際運作情形，進而能融合牧靈諮商知識與實務，增進末來牧靈諮商的實務能力。
修課條件：必須完成諮商專業學分10學分（必修學分）。
牧靈諮商技巧（下）
原諮商歷程與牧靈
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了解牧靈諮商歷程的階段、特性與內涵， 以及個案概念化和診斷，能初步了解他人生命故事及提供個别諮商之經驗，更增進對自己的行為模式、支持系統、動機與防衛機轉的覺察，進而能初步將屬靈操練加入諮商歷程中。
修課條件：必須修過【諮商理論與牧靈】、【牧靈諮商技巧（上）】、【助人者的心靈 健康】三門基礎課程。
醫治學
- 幫助學生了解醫治學的各種理論與方法。內容包括：醫治學的聖經基礎、醫治學各派理論、醫治學的重要主題、醫治禱告的內容與進行步驟等。透過課堂學習、討論及作業的操練，一方面讓學生自己經歷創傷得醫治、心靈轉化和生命更新，同時也學會如何為人作醫治釋放禱告，使人得著自由和全人健康。
身心疾患與牧靈
- 以聖經真理及心理學為根基，對人的了解運用到對身心疾病的認識，課程中實務與理論並進，藉著閱讀相關的書籍、文獻與實作，在不同的身心疾患中認識其心理困境，進而開啟靈性向度，朝向身、心、靈整合的健康方向邁進。
選修課程
- 性別議題與牧養
- 藝術治療
- 婚姻與家庭諮商
- 内在家庭系統(IFS,Internal family systems)
- 心理劇工作坊
教會社區服務與福音預工
- 清楚認識教會的社會使命，激發對所在社區、鄉鎮和城市的需要有積極主動的了解和關注，具備社區服務工作的規劃和行動能力，在教會服事當中使福音和服務兩方面並進，對所在的城、鎮、鄉、村、里等地方產生整全的影響力。
